Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SS18Q15532 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18Q15532 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18Q15532 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SS18Q15532 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms