Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH18Q13634 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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