Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms