Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2E1P29083 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2E1P29083 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms