Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms