Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNPPD1Q9BV87 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNPPD1Q9BV87 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNPPD1Q9BV87 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNPPD1Q9BV87 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms