Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP33Q8TEY7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms