Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3C1V9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3C1V9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3C1V9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3C1V9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3C1V9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3C1V9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3C1V9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3C1V9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3C1V9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3C1V9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3C1V9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3C1V9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3C1V9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms