Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCTN1Q2MV58 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCTN1Q2MV58 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms