Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 VAS1YGR094W 3315 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 RMT2YDR465C 1239 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 VMA8YEL051W 771 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 ADH4YGL256W 1149 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 QCR10YHR001W-A 234 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 DOG1YHR044C 741 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 EPT1YHR123W 1176 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PPX1YHR201C 1194 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 CFD1YIL003W 882 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 YKR011CYKR011C 1062 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 NIT3YLR351C 876 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 SEC14YMR079W 915 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 SSN8YNL025C 972 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 YPL107WYPL107W 747 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 POS5YPL188W 1245 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PLM2YDR501W 1566 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PMR1YGL167C 2853 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 RGC1YPR115W 3252 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 DRS2YAL026C 4068 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 VPS3YDR495C 3036 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PAU10YDR542W 363 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 GPP2YER062C 753 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PAU11YGL261C 363 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PAU13YHL046C 363 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 EMC2YJR088C 879 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PAU4YLR461W 363 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 SEC65YML105C 822 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 COS1YNL336W 1146 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 PHO88YBR106W 567 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF8Q12483 ITC1YGL133W 3795 nt2.84□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YML096WYML096W 1578 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 BMH2YDR099W 822 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 PMI40YER003C 1290 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YGR107WYGR107W 450 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 SAY1YGR263C 1275 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 AAH1YNL141W 1044 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DDI3YNL335W 678 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YOL024WYOL024W 519 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 ARO4YBR249C 1113 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 UBP14YBR058C 2346 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 ERG11YHR007C 1593 nt2.83□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 FAR1YJL157C 2493 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 IZH1YDR492W 951 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YHR180WYHR180W 492 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 SNX4YJL036W 1272 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YLR311CYLR311C 348 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RPN13YLR421C 471 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 CSM3YMR048W 954 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YNL184CYNL184C 327 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YBR300CYBR300C 498 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 ECM18YDR125C 1362 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 MON1YGL124C 1935 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 ROG1YGL144C 2058 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YDR222WYDR222W 1248 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DYN2YDR424C 279 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YHL005CYHL005C 393 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YHL045WYHL045W 348 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 GCD14YJL125C 1152 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 KRE2YDR483W 1329 nt2.81□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 TSC11YER093C 4293 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 SPP382YLR424W 2127 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 TOM70YNL121C 1854 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DUN1YDL101C 1542 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 PPH3YDR075W 927 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YDR090CYDR090C 933 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YDR290WYDR290W 330 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YPR1YDR368W 939 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 LRS4YDR439W 1044 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DDI2YFL061W 678 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 PIR1YKL164C 1026 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 AHP1YLR109W 531 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RPL6AYML073C 531 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YPL035CYPL035C 348 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 PIN3YPR154W 648 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DUF1YOL087C 3351 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 SEC27YGL137W 2670 nt2.8□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 BUD4YJR092W 4344 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 CEP3YMR168C 1827 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 CCT7YJL111W 1653 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 HFM1YGL251C 3564 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 FLO5YHR211W 3228 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 NUF2YOL069W 1356 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 ATG13YPR185W 2217 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RMD5YDR255C 1266 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 AST2YER101C 1293 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 PTI1YGR156W 1278 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 GTT1YIR038C 705 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 PHD1YKL043W 1101 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 ENV10YLR065C 546 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YLR290CYLR290C 834 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 SSU72YNL222W 621 nt2.79□□□□□ -1.96
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