Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2C1P98194 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms