Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00205P59089 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00205P59089 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms