Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 AIM25YJR100C 984 nt3.38□□□□□ -1.87
SEC28P40509 IMP1YMR150C 573 nt3.38□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MTL1YGR023W 1656 nt3.38□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MDV1YJL112W 2145 nt3.38□□□□□ -1.87
SEC28P40509 STU2YLR045C 2667 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 SSE2YBR169C 2082 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 IOC3YFR013W 2364 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YFL065CYFL065C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 PFS1YHR185C 714 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 TPM1YNL079C 600 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YOR062CYOR062C 807 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 SAS5YOR213C 747 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MYO5YMR109W 3660 nt3.37□□□□□ -1.87
SEC28P40509 SMC2YFR031C 3513 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 THO1YER063W 657 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 AIM11YER093C-A 414 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MPS2YGL075C 1164 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 PAU13YHL046C 363 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MMF1YIL051C 438 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 TIF34YMR146C 1044 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 RSM19YNR037C 276 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YLR352WYLR352W 2424 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 KIN3YAR018C 1308 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 TCP1YDR212W 1680 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 CDC40YDR364C 1368 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 HFM1YGL251C 3564 nt3.36□□□□□ -1.87
SEC28P40509 ENA2YDR039C 3276 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 ENA1YDR040C 3276 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 LRG1YDL240W 3054 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 BSC1YDL037C 987 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 HIM1YDR317W 1245 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 ECO1YFR027W 846 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YKR011CYKR011C 1062 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 ATG34YOL083W 1239 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 RPN8YOR261C 1017 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 EMP70YLR083C 2004 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YNR066CYNR066C 1311 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 VPS3YDR495C 3036 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 DNM1YLL001W 2274 nt3.35□□□□□ -1.87
SEC28P40509 SEC27YGL137W 2670 nt3.34□□□□□ -1.87
SEC28P40509 PSF1YDR013W 627 nt3.34□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MPC1YGL080W 393 nt3.34□□□□□ -1.87
SEC28P40509 RPL22AYLR061W 366 nt3.34□□□□□ -1.87
SEC28P40509 AAR2YBL074C 1068 nt3.34□□□□□ -1.87
SEC28P40509 CSH1YBR161W 1131 nt3.34□□□□□ -1.87
SEC28P40509 ERV15YBR210W 429 nt3.34□□□□□ -1.87
SEC28P40509 UBP8YMR223W 1416 nt3.34□□□□□ -1.88
SEC28P40509 ENA5YDR038C 3276 nt3.34□□□□□ -1.88
SEC28P40509 SIZ1YDR409W 2715 nt3.34□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PKH1YDR490C 2301 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 SNU23YDL098C 585 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RGI2YIL057C 495 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YVH1YIR026C 1095 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 VMA5YKL080W 1179 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YMR141CYMR141C 309 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 BAG7YOR134W 1230 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 ATG29YPL166W 642 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 SUP45YBR143C 1314 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YDR131CYDR131C 1671 nt3.33□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RPS14AYCR031C 414 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PUG1YER185W 912 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 LST7YGR057C 729 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 TDA10YGR205W 873 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RAD33YML011C 534 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 BET5YML077W 480 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YMR087WYMR087W 855 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 ECM13YBL043W 774 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 SSN8YNL025C 972 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 GIS2YNL255C 462 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RFC3YNL290W 1023 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PPT2YPL148C 522 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 APD1YBR151W 951 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PTM1YKL039W 1572 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 ENP2YGR145W 2124 nt3.32□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RED1YLR263W 2484 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 AKR1YDR264C 2295 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RPC37YKR025W 849 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YLR400WYLR400W 474 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RPN13YLR421C 471 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PML39YML107C 1005 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 TRI1YMR233W 681 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 IMP4YNL075W 873 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 YNL320WYNL320W 855 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PFY1YOR122C 381 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 PNO1YOR145C 825 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 CTP1YBR291C 900 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 UBP5YER144C 2418 nt3.31□□□□□ -1.88
SEC28P40509 CHA4YLR098C 1947 nt3.31□□□□□ -1.88
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