Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF3O75054 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF3O75054 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms