Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QLW9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QLW9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QLW9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QLW9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QLW9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QLW9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QLW9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3QLW9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QLW9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3QLW9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
J3QLW9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms