Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms