Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC78A2IDD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms