Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHAC2Q9Y5I4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHAC2Q9Y5I4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms