Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RABGEF1Q9UJ41 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RABGEF1Q9UJ41 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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