Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PNPLA3Q9NST1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNPLA3Q9NST1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms