Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43Q96BQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43Q96BQ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms