Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM18Q96B42 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms