Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC47Q96A33 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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