Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RP9Q8TA86 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RP9Q8TA86 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms