Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
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