Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 BMT5YIL096C 1011 nt3.02□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 LAC1YKL008C 1257 nt3.02□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YBR053CYBR053C 1077 nt3.02□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.02□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 NSP1YJL041W 2472 nt3.02□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YJR030CYJR030C 2238 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MON1YGL124C 1935 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 LCB4YOR171C 1875 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 VIP1YLR410W 3441 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YML096WYML096W 1578 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 NHP10YDL002C 612 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 NKP1YDR383C 717 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 BCD1YHR040W 1101 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SDP1YIL113W 630 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SNX4YJL036W 1272 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SIC1YLR079W 855 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 CTL1YMR180C 963 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 snR11snR11 258 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 UBS1YBR165W 834 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RIT1YMR283C 1542 nt3.01□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RDS2YPL133C 1341 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 REG1YDR028C 3045 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 CIN1YOR349W 3045 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 PAU10YDR542W 363 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 GPP2YER062C 753 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 PAU11YGL261C 363 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YGR190CYGR190C 366 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 PAU13YHL046C 363 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RDN58-1RDN58-1 158 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RDN58-2RDN58-2 158 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 PAU4YLR461W 363 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RPL19BYBL027W 570 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RUF20RUF20 443 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 TPM1YNL079C 600 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YPL035CYPL035C 348 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 CET1YPL228W 1650 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MTR4YJL050W 3222 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YHR080CYHR080C 4038 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 IOC3YFR013W 2364 nt3□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SIZ1YDR409W 2715 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RRG1YDR065W 1098 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 PAN5YHR063C 1140 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 ANB1YJR047C 474 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SOD1YJR104C 465 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 AHP1YLR109W 531 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 OST6YML019W 999 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SEC65YML105C 822 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YOR114WYOR114W 885 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 TUM1YOR251C 915 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YPR142CYPR142C 564 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MRPL27YBR282W 441 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 AUS1YOR011W 4185 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RNT1YMR239C 1416 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MDV1YJL112W 2145 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YJR061WYJR061W 2808 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RPN4YDL020C 1596 nt2.99□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 ISC10YER180C 804 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 TAN1YGL232W 870 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 PTI1YGR156W 1278 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YMR141CYMR141C 309 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 GOT1YMR292W 417 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 HHF2YNL030W 312 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 BAG7YOR134W 1230 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SAS5YOR213C 747 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MRP2YPR166C 348 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 STU1YBL034C 4542 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MYO5YMR109W 3660 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YLR352WYLR352W 2424 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 GCN1YGL195W 8019 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MSH2YOL090W 2895 nt2.98□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 EMP70YLR083C 2004 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YDL176WYDL176W 2127 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RNH202YDR279W 1053 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YFL065CYFL065C 309 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 PCL7YIL050W 858 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YVH1YIR026C 1095 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 MTD1YKR080W 963 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YLR042CYLR042C 486 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 YLR290CYLR290C 834 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 GLO1YML004C 981 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SHH3YMR118C 591 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 ATG16YMR159C 453 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 RPA43YOR340C 981 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 DUN1YDL101C 1542 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 TRS120YDR407C 3870 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 SSM4YIL030C 3960 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 REC8YPR007C 2043 nt2.97□□□□□ -1.93
PRP46Q12417 CHS3YBR023C 3498 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 AIM6YDL237W 1173 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YGR168CYGR168C 1131 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YHR022CYHR022C 771 nt2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.9 ms