Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ABCE1P61221 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCE1P61221 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms