Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHKA1P46020 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms