Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms