Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTNP21246 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTNP21246 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTNP21246 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTNP21246 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTNP21246 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTNP21246 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTNP21246 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTNP21246 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTNP21246 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTNP21246 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTNP21246 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTNP21246 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTNP21246 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms