Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PABPC1P11940 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms