Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEFLP07196 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEFLP07196 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEFLP07196 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEFLP07196 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFLP07196 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFLP07196 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFLP07196 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFLP07196 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFLP07196 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFLP07196 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEFLP07196 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEFLP07196 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEFLP07196 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEFLP07196 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms