Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRP68Q9UHB9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms