Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC93Q567U6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC93Q567U6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms