Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3C1V9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3C1V9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3C1V9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3C1V9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3C1V9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3C1V9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3C1V9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3C1V9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3C1V9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3C1V9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3C1V9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms