Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS1P54277 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS1P54277 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS1P54277 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS1P54277 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS1P54277 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS1P54277 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS1P54277 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS1P54277 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PMS1P54277 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS1P54277 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS1P54277 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS1P54277 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS1P54277 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS1P54277 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS1P54277 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS1P54277 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS1P54277 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS1P54277 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS1P54277 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS1P54277 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS1P54277 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS1P54277 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS1P54277 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms