Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MTHFD1P11586 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTHFD1P11586 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms