Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP19O94966 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP19O94966 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP19O94966 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP19O94966 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP19O94966 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP19O94966 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP19O94966 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP19O94966 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP19O94966 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP19O94966 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP19O94966 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP19O94966 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP19O94966 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP19O94966 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP19O94966 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP19O94966 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP19O94966 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP19O94966 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP19O94966 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP19O94966 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms