Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LDB2O43679 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LDB2O43679 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDB2O43679 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LDB2O43679 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LDB2O43679 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms