Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms