Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms