Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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