Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1CQ15572 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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