Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYO1EQ12965 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO1EQ12965 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms