Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
GRIN2AQ12879 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
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