Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 SVS1YPL163C 783 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 ARL1YBR164C 552 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YMR111CYMR111C 1389 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 GRS1YBR121C 2004 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 ADY4YLR227C 1482 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 JJJ1YNL227C 1773 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 TRE2YOR256C 2430 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 RRP3YHR065C 1506 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YDR417CYDR417C 372 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 IZH1YDR492W 951 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YER068C-AYER068C-A 432 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 ACP1YKL192C 378 nt5.14□□□□□ -1.59 RIP-Chip
PUF3Q07807 YLR171WYLR171W 390 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 COX7YMR256C 183 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 TRS33YOR115C 807 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 snR41snR41 95 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YDL109CYDL109C 1944 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YDR131CYDR131C 1671 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 HXT4YHR092C 1731 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 GAS4YOL132W 1416 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 HFD1YMR110C 1599 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YCL075WYCL075W 441 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 HNT2YDR305C 654 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 PUG1YER185W 912 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YER187WYER187W 426 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YFL051CYFL051C 483 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 COX13YGL191W 390 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YGR039WYGR039W 312 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 CAB4YGR277C 918 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YIL029CYIL029C 429 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YAF9YNL107W 681 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 GCY1YOR120W 939 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YOR387CYOR387C 621 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 ERV15YBR210W 429 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 HCA4YJL033W 2313 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 DAS1YJL149W 1992 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 TOS3YGL179C 1683 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 VPS17YOR132W 1656 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 PHR1YOR386W 1698 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 ECT1YGR007W 972 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 VMA22YHR060W 546 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 CDC12YHR107C 1224 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YIL161WYIL161W 708 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YAP5YIR018W 738 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 PBA1YLR199C 831 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YOL159CYOL159C 516 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YNG1YOR064C 660 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YCL012CYCL012C 405 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YJL049WYJL049W 1353 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YEL067CYEL067C 588 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 THO1YER063W 657 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YKL136WYKL136W 399 nt5.11□□□□□ -1.59 RIP-Chip
PUF3Q07807 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YBL010CYBL010C 843 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 snR9snR9 187 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 APA2YDR530C 978 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 SLX9YGR081C 633 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 SRP40YKR092C 1221 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 ARV1YLR242C 966 nt5.1□□□□□ -1.59 RIP-Chip
PUF3Q07807 NOP12YOL041C 1380 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 NAT3YPR131C 588 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 HPC2YBR215W 1878 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 SRB6YBR253W 366 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 MCM4YPR019W 2802 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YMR102CYMR102C 2505 nt5.09□□□□□ -1.59 RIP-Chip
PUF3Q07807 PMT5YDL093W 2232 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 THI20YOL055C 1656 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 HMRA2YCR096C 360 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 RRP42YDL111C 798 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 SMB1YER029C 591 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 SPT2YER161C 1002 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 LOC1YFR001W 615 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 LRP1YHR081W 555 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YHR130CYHR130C 336 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YJL169WYJL169W 369 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 ARC18YLR370C 537 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 MDG1YNL173C 1101 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 PPG1YNR032W 1107 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YPL062WYPL062W 405 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 NHP6AYPR052C 282 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.09□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 MSC7YHR039C 1935 nt5.09□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 AZR1YGR224W 1842 nt5.09□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 MBP1YDL056W 2502 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 IMD3YLR432W 1572 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 PAL1YDR348C 1500 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 TUB2YFL037W 1374 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 YCL076WYCL076W 744 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 SPG3YDR504C 384 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 YER084WYER084W 387 nt5.08□□□□□ -1.6
PUF3Q07807 SDO1YLR022C 753 nt5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.2 ms