Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH5P33151 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH5P33151 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH5P33151 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH5P33151 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH5P33151 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH5P33151 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH5P33151 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH5P33151 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms