Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEFLP07196 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFLP07196 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEFLP07196 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEFLP07196 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFLP07196 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFLP07196 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFLP07196 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFLP07196 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFLP07196 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFLP07196 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFLP07196 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFLP07196 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFLP07196 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFLP07196 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFLP07196 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFLP07196 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFLP07196 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFLP07196 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms