Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
N4BP1O75113 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms