Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC78A2IDD5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC78A2IDD5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms